寶可夢熱潮傳出背後有美國中央情報局（CIA）介入的陰謀論，指其利用遊戲控制玩家蒐集全球情資，並掌握個資供其運用。不僅如此，基督教友也摻一腳，指寶可夢和魔鬼掛鉤，是個擁有大數據且可操控生活的遊戲。引來看法不同的教友論戰。
打上關鍵字CIA和寶可夢，可找到一堆「寶可夢是中情局設下的陰謀」轉載文，指向遊戲製作公司Niantic幕後金主是CIA，且運用美軍研發衛星監控技術設計遊戲，LBS移動定位服務所需的衛星地圖也出自Niantic之手，全面操控玩家取得任何地理情資。
文章還指出，玩家不但個資被看光光，被賣還幫忙數錢，虛擬道館、補給站跟真實商業結合，就成一間間購物站，等著消費者上門；異議網民認為想像太豐富，個資早就被臉書、LINE等社交平台看光光，不差寶可夢。
宗教論戰也風行，有人舉出創作者曾說遊戲背後有反宗教目的，但很快被證實是假消息。美國教會更反其道而行開設補給站，香港神學家寫了「完全Pokmon Go布道手冊」，希望藉遊戲來傳福音。
教友半瓶醋（筆名）認為，「不用為遊戲大呼小叫，看得到威脅都不恐怖，參不透的才是令人擔憂。」也有教友認為，此舉挑起信仰論戰，任何東西都可能被說成帶有邪惡目的，感覺有如製造魔女。